本發(fā)明公開了一種新能源有功控制方法及系統(tǒng)，屬于電力系統(tǒng)運行與控制技術領域。本發(fā)明采取分階段的優(yōu)化策略。第一階段，以參與有功控制優(yōu)化決策的新能源場站、其他常規(guī)機組的有功指令與綜合指標的乘積之和最大作為優(yōu)化目標，通過綜合指標引導新能源優(yōu)先發(fā)電；第二階段，若新能源發(fā)電受限于聯(lián)絡線計劃，則以前一階段的優(yōu)化解分別作為新能源場站的指令下限和常規(guī)機組的指令上限，并松弛聯(lián)絡線計劃，最終得到考慮聯(lián)絡線松弛后的新能源場站的有功指令。