本發(fā)明涉及一種軌道交通車輛用不對稱輔助供電系統(tǒng)及其充電方法，所述系統(tǒng)包括：鈦酸鋰電池箱Ⅰ、充電機Ⅰ、輔助充電機Ⅰ、鈦酸鋰電池箱Ⅱ、充電機Ⅱ、輔助充電機Ⅱ、整車控制器CCU、110V直流母線、AC380V電源接口Ⅰ、AC380V電源接口Ⅱ、BMS電池管理系統(tǒng)Ⅰ、BMS電池管理系統(tǒng)Ⅱ、AC380V電源接口Ⅲ和AC380V電源接口Ⅳ，本發(fā)明通過整車控制器CCU調(diào)整輔助供電系統(tǒng)不對稱結(jié)構(gòu)導(dǎo)致的輔助充電機不均流問題。整車控制器CCU對充電電壓值進(jìn)行取小，然后發(fā)送給所有充電機，從而實現(xiàn)充電機的均流輸出。本發(fā)明適用于多種軌道交通車輛，安全又可靠。