本發(fā)明公開了一種利用微生物轉(zhuǎn)化黃芪總皂苷制備黃芪甲苷的方法，其包括步驟：將細(xì)菌、霉菌和酵母菌制成菌懸液或孢子懸浮液，接種于種子培養(yǎng)基中制成種子液，再將種子液接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng)，生長好后投入黃芪總皂苷進(jìn)行轉(zhuǎn)化，TLC掃描分析其他黃芪皂苷轉(zhuǎn)化為黃芪甲苷，使黃芪甲苷的量提高3倍以上，轉(zhuǎn)化液通過有機(jī)溶劑萃取和大孔樹脂分離純化得到黃芪甲苷純品。本發(fā)明方法能克服化學(xué)法水解黃芪總皂苷存在的對皂苷破壞達(dá)、污染嚴(yán)重、目的性差等缺點(diǎn)，以及酶法水解黃芪總皂苷過程中酶不穩(wěn)定性問題。具有無污染、專一性強(qiáng)、轉(zhuǎn)化率高的優(yōu)點(diǎn)，制備的黃芪甲苷純度可達(dá)99.9%以上。