本發(fā)明屬于計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)技術(shù)領(lǐng)域，特別是涉及一種基于藥物化學(xué)轉(zhuǎn)化規(guī)則的先導(dǎo)化合物優(yōu)化方法。所述方法包括：獲取待分析靶點(diǎn)的歷史實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，根據(jù)歷史實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)通過(guò)QSAR?assisted?MMPA方法獲得轉(zhuǎn)換庫(kù)；獲取待改造化合物結(jié)構(gòu)，將轉(zhuǎn)換庫(kù)的轉(zhuǎn)換規(guī)則應(yīng)用于待改造化合物結(jié)構(gòu)，并根據(jù)預(yù)設(shè)的篩選方法獲得最優(yōu)分子。該方法通過(guò)擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換，并通過(guò)循環(huán)設(shè)計(jì)、合成、生物測(cè)試的優(yōu)化化合物結(jié)構(gòu)構(gòu)成，具有可行性和可靠性，可獲得多目標(biāo)優(yōu)化的具有期望化學(xué)、物理或結(jié)構(gòu)特性的化合物。