本發(fā)明涉及用于在裝置中進行分子反應(yīng)的方法，包括如下步驟:(a)將一或多種試劑溶液和不混溶中間流體引入所述裝置中，其中所述裝置包含其上固定有化學(xué)或生化可識別實體的基材；(b)在所述固定的化學(xué)或生化可識別實體與所述試劑溶液之間進行分子反應(yīng)；或者在存在所述試劑溶液時在所述固定的化學(xué)或生化可識別實體上進行分子反應(yīng)；(c)用所述不混溶中間流體替換存在于所述基材上的試劑溶液；(d)分離所述不混溶中間流體和所述試劑溶液；和重利用所述試劑溶液和/或不混溶中間流體進行一或多次步驟(a)至(e)的重復(fù)。本發(fā)明還涉及用于進行分子反應(yīng)的裝置，包含反應(yīng)區(qū)，儲存器和液體連接件，以及其中所述不混溶中間流體和所述試劑溶液可由重力分離來分離的收集和再生區(qū)、或者其中將不混溶中間流體和試劑溶液分離的重導(dǎo)向和分配模塊。本發(fā)明還涉及不混溶中間流體用于替換微觀流體裝置的反應(yīng)區(qū)中存在的試劑溶液的用途，以及相應(yīng)的裝置用于進行測序反應(yīng)或核酸合成反應(yīng)的用途。