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基于輕量級深度卷積網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角預(yù)測方法

718   編輯:管理員   來源:中冶有色技術(shù)網(wǎng)  
2023-03-19 07:27:49
本發(fā)明公開一種基于輕量級深度卷積網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角預(yù)測方法,包括:基于PISCES服務(wù)器構(gòu)建蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角數(shù)據(jù)集;從RCSB PDB數(shù)據(jù)庫中抽取各蛋白質(zhì)序列中每個氨基酸殘基對應(yīng)的扭轉(zhuǎn)角Phi和Psi,并加入數(shù)據(jù)集中;將uniref90數(shù)據(jù)庫與各蛋白質(zhì)序列進行多序列比對,生成對應(yīng)蛋白質(zhì)序列的PSSM譜矩陣,基于PSSM譜矩陣及氨基酸的物理化學(xué)特性,構(gòu)造蛋白質(zhì)序列特征;設(shè)計殘差模塊,并基于該模塊構(gòu)建預(yù)測蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角的深度卷積網(wǎng)絡(luò)模型;構(gòu)建訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò)模型的損失函數(shù);基于構(gòu)建的損失函數(shù)訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò)模型;基于訓(xùn)練后的網(wǎng)絡(luò)模型進行蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角的預(yù)測。本發(fā)明不僅能精確地預(yù)測蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角,還具有模型小,預(yù)測速度快的優(yōu)點。
聲明:
“基于輕量級深度卷積網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)扭轉(zhuǎn)角預(yù)測方法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)
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