本發(fā)明涉及一種海域天然氣水合物有利聚集區(qū)主控因素的確定方法，包括如下步驟：步驟1：確定表征影響天然氣水合物聚集的多個地質(zhì)參數(shù)，并計算各個地質(zhì)參數(shù)；步驟2：選定若干個地質(zhì)參數(shù)作為系統(tǒng)特征，剩余的地質(zhì)參數(shù)作為系統(tǒng)因素，并得到系統(tǒng)特征序列和系統(tǒng)因素序列；步驟3：通過系統(tǒng)特征序列和系統(tǒng)因素序列之間的灰度關(guān)聯(lián)分析，得到主控因素；步驟4：將主控因素條件優(yōu)越的區(qū)域作為水合物有利聚集區(qū)。本發(fā)明基于水合物成藏系統(tǒng)基礎(chǔ)理論，通過系統(tǒng)特征序列和系統(tǒng)因素序列間的灰度關(guān)聯(lián)分析，可實現(xiàn)對不同構(gòu)造背景、多地質(zhì)因素影響下天然氣水合物聚集主控因素的定量評價，從而得到主控因素，根據(jù)主控因素科學(xué)指導(dǎo)水合物區(qū)域勘探及鉆探。