本發(fā)明屬于水生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種水生態(tài)系統(tǒng)環(huán)境質(zhì)量綜合評(píng)價(jià)方法。該方法主要包括以下的步驟：綜合評(píng)分，其具體步驟是，獲取以下五個(gè)數(shù)值：營(yíng)養(yǎng)鹽指數(shù)、棲息地質(zhì)量、浮游植物指數(shù)、微生物指數(shù)、魚(yú)類(lèi)指數(shù)，然后采用以下的公式進(jìn)行計(jì)算，獲得綜合得分：綜合得分=（營(yíng)養(yǎng)鹽指數(shù)+棲息地質(zhì)量+浮游植物指數(shù)+微生物指數(shù)+魚(yú)類(lèi)指數(shù)）/5；將綜合評(píng)分對(duì)應(yīng)于評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行評(píng)價(jià)，從而獲得水生態(tài)系統(tǒng)的環(huán)境質(zhì)量狀況。本發(fā)明的有益效果在于，篩選了能用于本發(fā)明方法的五個(gè)經(jīng)過(guò)了標(biāo)準(zhǔn)化指標(biāo)，首次提供了一種全面、綜合性的水生態(tài)環(huán)境質(zhì)量評(píng)價(jià)方法，使得通過(guò)該方法所獲得的結(jié)果更加接近水生態(tài)環(huán)境的真實(shí)情況。