本發(fā)明涉及甲殼素萃取技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種高效發(fā)酵的復(fù)合甲殼素萃取工藝，解決了現(xiàn)有技術(shù)中在進行甲殼素的萃取時，常常存在效率低、污染大、沒有衍生物以及利用率低的問題，進而大大影響甲殼素的整體萃取效率的問題。一種高效發(fā)酵的復(fù)合甲殼素萃取工藝，包括將原料進行接收以及儲存，其中原料采用天然的蝦蟹，以及糖和檸檬酸，將原材料中的蝦蟹進行研磨，在進行研磨時采用超凈超微粉研磨工藝以及設(shè)備，將研磨之后的蝦蟹與糖以及檸檬酸進行充分的混合，將原材料的混合物進行發(fā)酵，采用微生物一體式發(fā)酵技術(shù)。本發(fā)明提取效率的增加，且不會有廢水產(chǎn)生因此成本更低，只有酸堿法的1/3，酶解法的1/5，價格低，產(chǎn)品質(zhì)量好。