本發(fā)明涉及一種醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)醫(yī)療廢物的綜合處理方法及系統(tǒng)。所述方法包括以下步驟：S1、醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)將液體類的廢棄一般性藥品獨(dú)立收集，進(jìn)行固液分離，固體直接打包稱重，液體排入內(nèi)部醫(yī)療廢物站，經(jīng)處理后排至城市污水處理系統(tǒng)；將同時(shí)包含金屬和塑料的一次性使用醫(yī)療用品及一次性醫(yī)療器械獨(dú)立收集，進(jìn)行金屬和塑料的分離，并分開打包；其他的醫(yī)療廢物打包稱重；S2、將醫(yī)療廢物交給醫(yī)療廢物集中處置單位；S3、運(yùn)送、貯存和處置醫(yī)療廢物。所述系統(tǒng)包括實(shí)施上述方法的各組件。本發(fā)明提供了全面系統(tǒng)的醫(yī)療廢物綜合處理方案，將特定種類的醫(yī)療廢物進(jìn)行單獨(dú)收集和處理，大幅降低了醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的財(cái)務(wù)支出，并減少了醫(yī)療廢物的危害。