可將多模態(tài)對比用于產(chǎn)生圖像，可組合和再現(xiàn)所述圖像以產(chǎn)生與在透射白光照明下觀察到的利用波長吸收染色產(chǎn)生的圖像相似的圖像。可使用所設(shè)計(jì)的著色方案基于用于顯現(xiàn)相同解剖學(xué)結(jié)構(gòu)和組織化學(xué)的典型對比法來呈現(xiàn)利用其它互補(bǔ)對比模態(tài)獲得的圖像，從而提供與醫(yī)療訓(xùn)練和經(jīng)驗(yàn)的相關(guān)性。將源自折射率的暗場對比圖像和熒光DAPI復(fù)染色圖像組合以產(chǎn)生與利用常規(guī)H&E染色獲得的圖像相似的圖像，以進(jìn)行病理學(xué)解釋?？闪魇絺鬏斶@樣的多模態(tài)圖像數(shù)據(jù)以進(jìn)行組織學(xué)樣品的現(xiàn)場導(dǎo)航，并且可將其與基因DNA探針的分子定位(FISH)、mRNA表達(dá)的位置(mRNA-ISH)和定位在相同組織切片上的免疫組織化學(xué)(IHC)探針組合，用于評估和映射制備用于質(zhì)譜成像的組織切片。