本發(fā)明屬于水稻基因工程技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種水稻染色質(zhì)變構(gòu)因子基因CHR729在控制水稻發(fā)育中的應(yīng)用。其特征在于，所述的染色質(zhì)變構(gòu)因子CHR729的編碼序列如序列表SEQ？ID？NO：1所示，共6780個(gè)bp，編碼2259個(gè)氨基酸。通過RNAi技術(shù)下降表達(dá)這個(gè)基因會(huì)產(chǎn)生很多嚴(yán)重的表型，包括植株變矮，葉片(營(yíng)養(yǎng)葉和劍葉)變窄，抽穗期推遲及種子變窄等。通過石蠟切片技術(shù)發(fā)現(xiàn)葉片的細(xì)胞數(shù)目減少。DNA損傷的化學(xué)試劑MMS處理中花11以后檢測(cè)CHR729基因表達(dá)量下降，說明它可能參與DNA損傷的信號(hào)傳導(dǎo)。6-BA處理野生型及RNAi材料，OsRR7誘導(dǎo)表達(dá)在RNAi材料中變慢，說明CHR729可能參與細(xì)胞分裂素應(yīng)答的調(diào)控。通過體外結(jié)合實(shí)驗(yàn)我們還發(fā)現(xiàn)CHR729能夠通過它的PHD結(jié)構(gòu)域在體外與三甲基化H3K27結(jié)合。