本發(fā)明公開了一種基于浸潤性區(qū)域化精準修飾的納米孔道膜，所述納米孔道膜內(nèi)表面修飾有疏水涂層，所述納米孔道膜外表面修飾有親水涂層和復合DNA探針；本發(fā)明還提供一種基于浸潤性區(qū)域化精準修飾的納米孔道膜的制備方法，包括以下步驟：步驟S1、采用化學氣相沉積法將疏水涂層沉積于納米孔道膜內(nèi)表面和外表面；步驟S2、將所述步驟S1的納米孔道膜使用物理氣相沉積法將親水涂層沉積在納米孔道膜的外表面；步驟S3、將所述步驟S3獲得的納米孔道膜接枝復合DNA探針；本發(fā)明還提供一種基于浸潤性區(qū)域化精準修飾的納米孔道膜檢測微囊藻毒素的方法。本發(fā)明具有提高檢測微囊藻毒素靈敏度的有益效果。