一種用于燃料電池系統(tǒng)的分布式管理方法。在燃料電池系統(tǒng)開(kāi)機(jī)啟用步驟中,先由輔助電力源對(duì)主控制單元與能源管理單元提供電力。主控制單元反復(fù)接收由能源管理單元所傳送的燃料電池狀態(tài)數(shù)據(jù),或是主動(dòng)向能源管理單元詢問(wèn),來(lái)判斷燃料電池系統(tǒng)是否發(fā)生異常運(yùn)作,以及隨時(shí)調(diào)控系統(tǒng)使其保持最佳運(yùn)作狀態(tài)。能源管理單元感測(cè)系統(tǒng)的狀態(tài),以產(chǎn)生對(duì)應(yīng)的狀態(tài)資料,然后向主控制單元主動(dòng)傳送或回饋該些狀態(tài)數(shù)據(jù)。在燃料電池系統(tǒng)關(guān)機(jī)步驟中,對(duì)仍位于流道內(nèi)的燃料進(jìn)行清除處理,以及對(duì)電化學(xué)反應(yīng)所產(chǎn)生的生成物且未排出的生成物進(jìn)行清除處理,并能儲(chǔ)存燃料電池在關(guān)機(jī)前的最后狀態(tài)。主控制單元及能源管理單元始終保持開(kāi)啟,以持續(xù)偵測(cè)燃料電池狀態(tài)。