本發(fā)明公開了一種碳基復合負極材料及其制備方法和鋰離子電池。所述碳基復合負極材料包括復合材料核心和包覆在復合材料核心表面的碳包覆層；所述復合材料核心包括第一組分和第二組分，所述第一組分嵌入在第二組分中；所述第一組分由納米活性物質(zhì)、第一碳粘結劑和天然石墨組成；所述第二組分由人造石墨和第二碳粘結劑組成。所述制備方法包括：1)制備第一組分；2)制備第一組分嵌入在第二組分中的復合物前驅體；3)進行碳包覆和燒結，得到所述碳基復合負極材料。本發(fā)明提供的負極材料因為第一組分和第二組分形成的復合結構，以及天然石墨與人造石墨間的協(xié)同作用，電化學性能優(yōu)良。