本發(fā)明屬藥物分析化學(xué)領(lǐng)域，具體涉及兩種分析測定泮托拉唑鈉及其合成起始原料5?二氟甲氧基?2?巰基?1H?苯并咪唑中潛在基因毒性雜質(zhì)的方法。該方法采用十八烷基硅烷鍵合硅膠為固定相，采用質(zhì)譜檢測器進行分析測定；所述流動相為含有乙腈、甲醇和有機銨鹽的水溶液；所述潛在基因毒性雜質(zhì)的結(jié)構(gòu)類型包括鹵代甲基吡啶類、氮雜芳基N?氧化物類、N??；被筋?、芳香胺類以及硝基苯類化合物。該方法不僅能實現(xiàn)泮托拉唑鈉及其合成起始原料中潛在基因毒性雜質(zhì)的有效分離，并且能夠?qū)λ龅幕蚨拘噪s質(zhì)進行準確的定量測定，方法的靈敏度高，專屬性強；實驗操作簡便、快速，對泮托拉唑鈉的質(zhì)量控制和用藥安全具有重要的意義。