本發(fā)明提供了來自PD?L1蛋白質(zhì)的具體的肽和這些肽的衍生電離特性，其特別有利于通過選擇反應(yīng)監(jiān)測(SRM)質(zhì)譜或也可稱作多反應(yīng)監(jiān)測(MRM)質(zhì)譜的方法直接定量已經(jīng)在福爾馬林中固定的生物樣品中的PD?L1蛋白質(zhì)。這類生物樣品是經(jīng)化學保藏和固定的，所述生物樣品選自使用含有試劑/固定劑的甲醛處理的組織和細胞，包括福爾馬林固定的組織/細胞、福爾馬林固定/石蠟包埋(FFPE)的組織/細胞、FFPE組織塊和來自那些塊的細胞，以及經(jīng)福爾馬林固定和或石蠟包埋的組織培養(yǎng)細胞。使用Liquid?TissueTM試劑和方案從所述生物樣品中制備蛋白質(zhì)樣品并通過在蛋白質(zhì)樣品中定量至少一種或多種所描述的肽來使用SRM/MRM質(zhì)譜的方法在Liquid?TissueTM樣品中定量PD?L1蛋白質(zhì)。這些肽在其以修飾的或未修飾的形式存在時可被定量。PD?L1片段肽的修飾的形式的一個示例是肽序列內(nèi)酪氨酸、蘇氨酸、絲氨酸和/或其他氨基酸殘基的磷酸化。