本發(fā)明涉及一種基于幾何圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)信號(hào)肽的預(yù)測方法及裝置，其方法包括：獲取數(shù)據(jù)集中的蛋白質(zhì)序列，提取其中信號(hào)肽的字符序列；對(duì)所述信號(hào)肽進(jìn)行特征提取，得到所述信號(hào)肽的序列進(jìn)化特征、物理化學(xué)特征、結(jié)構(gòu)特征、統(tǒng)計(jì)特征；將進(jìn)化特征、物理化學(xué)特征、結(jié)構(gòu)特征、統(tǒng)計(jì)特征進(jìn)行融合，得到多維向量；根據(jù)所述字符序列和所述多維向量構(gòu)建信號(hào)肽的特征圖；將所述特征圖作為幾何圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的輸入，訓(xùn)練所述幾何圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)直至其誤差低于閾值，保存所述幾何圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型并將其用于預(yù)測待預(yù)測信號(hào)肽。本發(fā)明結(jié)合幾何圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和字符序列，在保留了特征提取的原始信息同時(shí)，減少了模型過擬合，提高了信號(hào)肽預(yù)測的準(zhǔn)確率。