本發(fā)明公開一種基于異質(zhì)圖的藥物?蛋白質(zhì)靶向作用預(yù)測方法,包括:S1.通過獲取來自Drugbank、SIDER等數(shù)據(jù)庫的藥物,靶點以及疾病等信息,與已有的公開數(shù)據(jù)集進(jìn)行匹配整合,構(gòu)建藥物和靶點相關(guān)的異質(zhì)圖,并通過RDKit計算和基于成對的Smith?waterman得分獲得藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)信息和蛋白質(zhì)序列信息。S2.結(jié)合節(jié)點表示與圖級表示之間的互信息以及子結(jié)構(gòu)表示與圖級表示之間的互信息,從異構(gòu)信息中學(xué)習(xí)精確的和可解釋的特征嵌入,提出了一個端到端的多視圖自動編碼器模型完成鏈路預(yù)測的任務(wù)。本發(fā)明對于藥物重定向具有有益的科學(xué)指導(dǎo)作用,有利于發(fā)現(xiàn)潛在的藥物?蛋白質(zhì)靶點有效鏈接,加快舊藥新用的節(jié)奏。
聲明:
“基于異質(zhì)圖的藥物-蛋白質(zhì)靶向作用預(yù)測方法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
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