本發(fā)明提供一種基于染色體異常的乳腺癌預后評估的技術和方法，屬于醫(yī)學診斷技術領域。本發(fā)明通過測序確定了以下高頻拷貝數(shù)變異區(qū)域：1p3、1q2、1q4、2p2、6q、7p、8p11.21、8q24.21、10q2、11q1、11q13.3、15q2、16p1、16q、17p、17q12、20q1、20q13.2，這些區(qū)域出現(xiàn)缺失或擴增提示預后不良。本發(fā)明方法克服了腫瘤的生物學異質性；并且能夠自動化操作、分析，減少人工，并降低人為因素判定的偏差；此外，本發(fā)明方法較傳統(tǒng)流行病學、病理、免疫組織化學檢查更易標準化，分層更精細、精準。