本發(fā)明提供了一種藥物篩選模型構(gòu)建方法及裝置、篩選方法、設(shè)備和介質(zhì)，屬于藥物篩選領(lǐng)域，方法包括：獲取藥物訓(xùn)練集，藥物訓(xùn)練集包含藥物蛋白質(zhì)的化學(xué)式、小分子的化學(xué)式以及分類(lèi)標(biāo)簽；基于化學(xué)式，繪制藥物蛋白質(zhì)和小分子的初始圖網(wǎng)絡(luò)，初始圖網(wǎng)絡(luò)中原子為節(jié)點(diǎn)，化學(xué)鍵為連接節(jié)點(diǎn)的邊；采用隨機(jī)初始化向量標(biāo)識(shí)初始圖網(wǎng)絡(luò)中的各節(jié)點(diǎn)的權(quán)重向量；根據(jù)初始圖網(wǎng)絡(luò)的連接關(guān)系重構(gòu)初始圖網(wǎng)絡(luò)的各節(jié)點(diǎn)，得到重構(gòu)圖網(wǎng)絡(luò)，重復(fù)重構(gòu)步驟，得到至少兩層重構(gòu)圖網(wǎng)絡(luò)；根據(jù)分類(lèi)標(biāo)簽對(duì)初始圖網(wǎng)絡(luò)和至少兩層重構(gòu)圖網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行深度學(xué)習(xí)，構(gòu)建藥物篩選模型。通過(guò)本公開(kāi)的處理方案，可以準(zhǔn)確地對(duì)不同尺度的生物和化學(xué)實(shí)驗(yàn)中藥物化合物的性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè)。