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結(jié)合高壓分子動力學(xué)模擬、自由能計算改善水解酶魯棒性

1073   編輯:管理員   來源:中冶有色技術(shù)網(wǎng)  
2023-03-19 08:56:36
本發(fā)明公開了結(jié)合高壓分子動力學(xué)模擬、自由能計算改善水解酶魯棒性,屬于計算化學(xué)、生物信息學(xué)、基因工程以及蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域。本發(fā)明方法先通過高壓擾動結(jié)合分子動力學(xué)模型模擬計算,尋找強(qiáng)魯棒性相關(guān)區(qū)域和關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn),再對關(guān)鍵區(qū)域上的氨基酸進(jìn)行虛擬飽和突變,構(gòu)建突變體庫,然后通過用多尺度自由能計算軟件從蛋白質(zhì)動力學(xué)、蛋白質(zhì)熱力學(xué)、預(yù)測算法上對上述突變體進(jìn)行穩(wěn)定性預(yù)測,經(jīng)多輪虛擬選擇盡可能排除假陽性突變體。利用上述方法構(gòu)建篩選水解酶突變體,陽性突變體頻率高達(dá)62.5%,有效降低篩選工作量,獲得的突變體魯棒性強(qiáng),具有很高的工業(yè)應(yīng)用潛力。
聲明:
“結(jié)合高壓分子動力學(xué)模擬、自由能計算改善水解酶魯棒性” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)
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