本發(fā)明涉及一種基于氨基酸的磷系阻燃劑及其制備方法和應用，所述制備方法包括：將氨基酸與堿溶于有機溶劑中，經(jīng)過第一反應得到第一混合液；將所述第一混合液與醛類化合物混合，經(jīng)過第二反應得到第二混合液；將所述第二混合液與含磷化合物混合，經(jīng)過第三反應得到第三混合液；以及將所述第三混合液酸化，得到基于氨基酸的磷系阻燃劑。本發(fā)明的基于氨基酸的磷系阻燃劑不僅具備高阻燃效率，而且仍然保留有羧基等活性官能團，使得基于氨基酸的磷系阻燃劑仍然具有可反應性，在應用時能夠與聚合物基體發(fā)生反應，實現(xiàn)與聚合物基體的結合，從而能夠得到一種兼具優(yōu)異阻燃性能與優(yōu)異力學性能的聚合物復合材料。