一種基于三維地質(zhì)模型的多源地質(zhì)數(shù)據(jù)處理方法，方法包括如下步驟：S1、確定三維地質(zhì)模型，并且獲取多個(gè)種類的地質(zhì)數(shù)據(jù)；S2、在三維地質(zhì)模型中確定膨脹基點(diǎn)，并且確定膨脹步進(jìn)量；S3、以膨脹基點(diǎn)為中心基于膨脹步進(jìn)量生成多個(gè)三維面域，并且在三維面域中確定多個(gè)地質(zhì)信息點(diǎn)；S4、提取與膨脹基點(diǎn)和地質(zhì)信息點(diǎn)對(duì)應(yīng)的地質(zhì)數(shù)據(jù)，并且組成多個(gè)元數(shù)據(jù)；S5、對(duì)元數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化處理；S6、根據(jù)地質(zhì)信息點(diǎn)與三維面域的對(duì)應(yīng)關(guān)系對(duì)元數(shù)據(jù)進(jìn)行分組，得到多個(gè)數(shù)據(jù)組；S7、構(gòu)建表層數(shù)據(jù)空間和深層數(shù)據(jù)空間，并且將數(shù)據(jù)組輸入到表層數(shù)據(jù)空間和/或深層數(shù)據(jù)空間中。本發(fā)明能夠?qū)⒍嘣吹刭|(zhì)數(shù)據(jù)與三維地質(zhì)模型相融合，便于快速調(diào)用地質(zhì)數(shù)據(jù)。