本發(fā)明提出了一種區(qū)域地質(zhì)功能分區(qū)建模系統(tǒng)及建模方法，包括，地質(zhì)數(shù)據(jù)采集模塊，用于收集特定區(qū)域中的地質(zhì)數(shù)據(jù)；地表數(shù)據(jù)采集模塊，用于收集相應(yīng)區(qū)域的地表數(shù)據(jù)，構(gòu)建該區(qū)域地形圖數(shù)據(jù)；三維地表建模模塊，基于所述地表數(shù)據(jù)采集模塊得到的地表數(shù)據(jù)，構(gòu)建得到相應(yīng)區(qū)域的三維地表模型；三維地層體建模模塊，基于所述三維地表模型和所述地質(zhì)數(shù)據(jù)，構(gòu)建得到相應(yīng)區(qū)域的地層分布三維模型；三維地質(zhì)屬性分布模型建模模塊：用于得到相對應(yīng)的各類地質(zhì)屬性分布三維模型；地質(zhì)功能分區(qū)建模模塊用于生成得到各類地質(zhì)功能分區(qū)模型。基于地質(zhì)功能分區(qū)建模模塊得到的各類地質(zhì)功能分區(qū)模型，指導(dǎo)后續(xù)的區(qū)域規(guī)劃等應(yīng)用。