本發(fā)明涉及一種利用微生物定向產(chǎn)酶處理廢水的方法，包括如下步驟和工藝條件：1)制備培養(yǎng)用營(yíng)養(yǎng)液：有機(jī)營(yíng)養(yǎng)1～10％、無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)A類(lèi)0.5～2％、無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)B類(lèi)0.1～0.5％、微量元素0.3～1.5％、生物生長(zhǎng)素1.5～7％；2)制備活化微生物的培養(yǎng)液：由孢子態(tài)微生物、激活孢子態(tài)微生物所需的營(yíng)養(yǎng)液、水組成；3)制備次生代謝用營(yíng)養(yǎng)液：無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)A類(lèi)0.5～2％、無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)B類(lèi)0.1～0.5％、微量元素0.3～1.5％、生物生長(zhǎng)素1.5～7％；4)制備刺激微生物次生代謝產(chǎn)酶培養(yǎng)液：由步驟二所得培養(yǎng)液、步驟三所得次生代謝用營(yíng)養(yǎng)液、滅菌工業(yè)廢水、滅菌除氯自來(lái)水組成；5)現(xiàn)場(chǎng)持續(xù)投加菌液。本發(fā)明通過(guò)次生代謝產(chǎn)酶，有效地提高系統(tǒng)對(duì)難降解有機(jī)物的去除能力和系統(tǒng)的穩(wěn)定性。