本申請涉及污水處理技術(shù)領(lǐng)域，尤其是涉及一種難生物降解的高氨氮廢水的綜合處理系統(tǒng)及處理方法。本申請的難生物降解的高氨氮廢水的綜合處理系統(tǒng)，包括依次相連的兼氧反應(yīng)器、芬頓氧化反應(yīng)器、AO型生化反應(yīng)器；兼氧反應(yīng)器包括依次相連的第一、二兼氧反應(yīng)區(qū)、兼氧泥水分離區(qū)，第一兼氧反應(yīng)區(qū)設(shè)置有攪拌裝置和曝氣裝置，第二兼氧反應(yīng)區(qū)設(shè)置有曝氣裝置；芬頓氧化反應(yīng)器包括氧化反應(yīng)區(qū)、芬頓氧化泥水分離區(qū)；AO型生化反應(yīng)器包括依次相連的缺氧反應(yīng)區(qū)、好氧反應(yīng)區(qū)、AO泥水分離區(qū)，缺氧反應(yīng)區(qū)設(shè)置攪拌裝置，好氧反應(yīng)區(qū)設(shè)置曝氣裝置。本申請的難生物降解的高氨氮廢水的綜合處理系統(tǒng)能夠在較少的碳源和堿度補充的條件下即可使出水的氨氮含量充分降低。