本發(fā)明提供一種全轉(zhuǎn)錄組范圍單堿基分辨率檢測RNA N⁶?甲基腺嘌呤修飾的方法及試劑盒。該方法基于體內(nèi)核糖核酸(RNA)腺嘌呤的N⁶?烯丙基標(biāo)記并化學(xué)處理誘導(dǎo)其在逆轉(zhuǎn)錄成DNA過程中發(fā)生堿基突變，然后通過核酸測序手段識別突變位點(diǎn)，進(jìn)而得到a⁶A位點(diǎn)，該位點(diǎn)即為細(xì)胞RNA中原本m⁶A修飾的位點(diǎn)。本發(fā)明方法首次實(shí)現(xiàn)了在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行N⁶?烯丙基腺嘌呤的特異性標(biāo)記，該標(biāo)記不但能夠用于替換細(xì)胞內(nèi)的N⁶?甲基腺嘌呤位點(diǎn)，并且能夠借助突變測序的手段進(jìn)行定位。本發(fā)明方法與現(xiàn)有應(yīng)用于m⁶A檢測的基因測序技術(shù)相比，由于突變位點(diǎn)可以精確到單堿基的分辨率，提升了目前普遍采用的基于m⁶A抗體免疫沉淀與大規(guī)模平行測序方法檢測m⁶A位點(diǎn)的精度，是一個直接的高通量單堿基鑒定方法。