本發(fā)明涉及一種基于導(dǎo)電聚合物納米孔集成結(jié)構(gòu)的納米孔檢測(cè)系統(tǒng)及其制備方法，該系統(tǒng)包括電解質(zhì)溶液腔室、導(dǎo)電聚合物納米孔集成結(jié)構(gòu)和電流檢測(cè)系統(tǒng)；導(dǎo)電聚合物納米孔集成結(jié)構(gòu)包括設(shè)置有納米孔的納米孔層薄膜和具有微納結(jié)構(gòu)的導(dǎo)電聚合物薄膜；導(dǎo)電聚合物納米孔集成結(jié)構(gòu)設(shè)置于電解質(zhì)溶液腔室內(nèi)部并將其分成上腔室和下腔室形成通道；電流檢測(cè)系統(tǒng)設(shè)置于上和下腔室內(nèi)。本發(fā)明通過對(duì)固態(tài)納米孔進(jìn)行簡單的化學(xué)修飾，將導(dǎo)電聚合物和納米孔進(jìn)行集成，利用形成的多孔微納結(jié)構(gòu)使長鏈聚合物在穿過納米孔前的運(yùn)動(dòng)路徑復(fù)雜化，結(jié)合導(dǎo)電聚合物與長鏈聚合物分子間的靜電作用力，減緩甚至控制長鏈聚合物在納米孔中的傳輸速度，有效提高了納米孔檢測(cè)長鏈狀聚合物的可靠性。