本發(fā)明涉及一種基于分子親電矢量(MEV)和擴(kuò)展支持向量機(jī)(SVM)的基因毒性概率預(yù)測方法,適用于根據(jù)有機(jī)化合物分子結(jié)構(gòu)信息對該化合物進(jìn)行虛擬毒性評價和篩選。首先,對輸入分子結(jié)構(gòu)使用基于文本的化學(xué)結(jié)構(gòu)提問語言SMARTS和可編程原子分類PATTY回溯算法根據(jù)預(yù)定義規(guī)則進(jìn)行原子分類;然后,根據(jù)半經(jīng)驗HüCKEL方法計算分子中每種原子類型的原子描述符(前線軌道電子密度、電子超離域度、原子Π-電荷)建立描述分子的親電性質(zhì)的特征矢量MEV;最后,使用擴(kuò)展的支持向量機(jī)方法(SVM)對分子的基因毒性數(shù)據(jù)和及其特征MEV進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)習(xí),得到該分子基因毒性的后驗概率估計。
聲明:
“基于分子親電矢量和擴(kuò)展支持向量機(jī)的基因毒性概率預(yù)測方法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)