本發(fā)明公開(kāi)了一種基于小波變換支持向量機(jī)對(duì)蛋白質(zhì)功能與結(jié)構(gòu)的在線預(yù)報(bào)方法,該方法包括如下步驟:1.建立蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)集的訓(xùn)練樣本集;2.利用氨基酸的物理化學(xué)性質(zhì)將蛋白質(zhì)氨基酸序列轉(zhuǎn)化為數(shù)值序列;3.利用小波變換進(jìn)行特征提?。?.支持向量機(jī)訓(xùn)練生成的蛋白質(zhì)特征數(shù)據(jù)集;5.需要預(yù)報(bào)的蛋白質(zhì)序列的讀入、數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的在線預(yù)測(cè)。該方法能實(shí)現(xiàn)對(duì)未知蛋白質(zhì)的家族及功能的預(yù)測(cè),驗(yàn)證結(jié)果表明對(duì)G蛋白偶聯(lián)受體、酶蛋白、蛋白質(zhì)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)均有好的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率。在線預(yù)測(cè)時(shí),用戶只需在預(yù)報(bào)網(wǎng)頁(yè)界面提供要預(yù)報(bào)的蛋白質(zhì)序列,對(duì)其數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換后利用小波變換對(duì)其進(jìn)行特征提取,完成支持向量機(jī)的訓(xùn)練和目標(biāo)的預(yù)報(bào),輸出預(yù)報(bào)結(jié)果。
聲明:
“蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的在線預(yù)測(cè)方法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請(qǐng)聯(lián)系該技術(shù)所有人。
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