本發(fā)明涉及三維定量構(gòu)效關(guān)系模型的構(gòu)建方法，具體涉及以HIV-1抑制劑分子為基礎(chǔ)的三維定量構(gòu)效關(guān)系模型的建立及一致性模型構(gòu)建，屬于生物信息技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明選用HIV-1抑制劑分子進行3D-QSAR及一致性模型研究，目的在于挖掘抑制劑的結(jié)構(gòu)與其抗HIV活性的關(guān)系。本發(fā)明方法是基于抑制劑的化學(xué)特征(如親水、疏水、靜電、極性、三維結(jié)構(gòu)等)建立數(shù)學(xué)模型來預(yù)測具有類似結(jié)構(gòu)化合物的生物活性。本發(fā)明的一致性模型在三種3D-QSAR模型的基礎(chǔ)上采用統(tǒng)計學(xué)方法構(gòu)建，旨在進一步提高模型的預(yù)測能力。本發(fā)明所獲得的模型可以更好地預(yù)測化合物的抗HIV活性，提高預(yù)測全新化合物抑制HIV活性的準(zhǔn)確度，和其他方法相比提高了藥物發(fā)現(xiàn)的效率，降低了藥物發(fā)現(xiàn)的成本。