本發(fā)明公開(kāi)深度測(cè)序基因序列數(shù)據(jù)文件的無(wú)損壓縮方法，以傳輸過(guò)程中不需要傳輸?shù)膬?nèi)置標(biāo)準(zhǔn)參考基因組和內(nèi)置字典文件作為對(duì)比。因此如果傳輸或者存儲(chǔ)過(guò)程中丟失轉(zhuǎn)換后的基因序列或者本專利壓縮后的基因序列數(shù)據(jù)的話，只要其他人員無(wú)法取得內(nèi)置標(biāo)準(zhǔn)基因和內(nèi)置字典文件，就無(wú)法還原相關(guān)的序列，大大加強(qiáng)了安全性。未匹配上的變異，增設(shè)臨時(shí)字典，該字典隨著文件壓縮和傳輸。如果第一次未匹配到的特殊變異寫(xiě)入該字典后，后面幾百甚至上萬(wàn)次測(cè)序數(shù)據(jù)中出現(xiàn)的該特殊變異就不用另外存儲(chǔ)，大大節(jié)省了空間。本發(fā)明有效的降低了DNA測(cè)序序列的數(shù)據(jù)容量，因此無(wú)論存儲(chǔ)還是傳輸過(guò)程中容量大大減小了。