本發(fā)明提供一種燃料電池混合動(dòng)力系統(tǒng)的控制方法及系統(tǒng)，所述燃料電池混合動(dòng)力系統(tǒng)包括鋰電池和燃料電池，所述方法包括：在燃料電池+鋰電池雙動(dòng)力模式下，若車(chē)輛運(yùn)行狀態(tài)發(fā)生變更，則維持燃料電池輸出功率，并基于車(chē)輛電機(jī)動(dòng)力系統(tǒng)的當(dāng)前需求功率，調(diào)節(jié)鋰電池當(dāng)前輸出功率；若該當(dāng)前需求功率大于燃料電池的設(shè)定最小輸出功率，則基于鋰電池的當(dāng)前荷電狀態(tài)和車(chē)輛電機(jī)動(dòng)力系統(tǒng)的當(dāng)前需求功率，利用多目標(biāo)自適應(yīng)控制算法，計(jì)算燃料電池的期望輸出功率；基于期望輸出功率，在預(yù)設(shè)燃料電池輸出調(diào)整時(shí)間內(nèi)，平滑調(diào)節(jié)燃料電池的實(shí)際輸出功率。本發(fā)明能夠使燃料電池在不同運(yùn)行工況下平穩(wěn)運(yùn)行，并能有效提高燃料使用效率，延長(zhǎng)電堆使用壽命。