本實用新型提供了一種化學(xué)制藥廢水處理系統(tǒng)，包括依次設(shè)置的氧化池、第一混凝沉淀池、pH回調(diào)池、ABR折流反應(yīng)器、A/O池和第二混凝沉淀池，第一混凝沉淀池包括堿反應(yīng)池、第一PAC反應(yīng)池、第一PAM反應(yīng)池和第一沉淀分離池，第二混凝沉淀池包括第二PAC反應(yīng)池、第二PAM反應(yīng)池和第二沉淀分離池。該化學(xué)制藥廢水處理系統(tǒng)能高效率的去除化學(xué)制藥廢水中的有機基質(zhì)、脂類物質(zhì)、硝酸鹽和亞硝酸鹽等，解決了化學(xué)制藥廢水因具有的廢水成分復(fù)雜和水質(zhì)不穩(wěn)等特點而難以處理的問題。