本發(fā)明涉及一種低硫生物柴油的制備方法，該方法包括如下步驟：原料油經(jīng)換熱、預(yù)熱、甘油酯化反應(yīng)、閃蒸、冷卻、酯交換反應(yīng)、脫醇、沉降、甲酯精餾得到達(dá)標(biāo)的低硫生物柴油；其中換熱工序中原料油與閃蒸后的油換熱回收部分熱量，閃蒸蒸出物中的甘油和脂肪酸回用于甘油酯化反應(yīng)；脫醇工序脫除酯交換反應(yīng)后體系中的甲醇，經(jīng)過甲醇精餾回收的精甲醇回用于酯交換反應(yīng)；沉降工序中產(chǎn)生的粗甘油無需處理直接進(jìn)行甘油精餾得到精甘油，精甘油回用于甘油酯化反應(yīng)。本發(fā)明清潔高效，無硫酸廢水，適用范圍廣，反應(yīng)時(shí)間短，降酸徹底，油脂轉(zhuǎn)化率高，熱量循環(huán)利用，能耗低，未反應(yīng)的甲醇及副產(chǎn)物甘油回收利用，生產(chǎn)成本低，適合工業(yè)化生產(chǎn)。本發(fā)明能穩(wěn)定生產(chǎn)得到硫含量低于10ppm符合歐盟標(biāo)準(zhǔn)的高品位低硫生物柴油。