本發(fā)明涉及一種利用異養(yǎng)微藻凈化海水養(yǎng)殖尾水的方法，屬于海水養(yǎng)殖尾水處理領(lǐng)域，所述微藻為蛋白核小球藻，將異養(yǎng)發(fā)酵培養(yǎng)的小球藻經(jīng)離心、洗滌2次后，進(jìn)行光自養(yǎng)轉(zhuǎn)換和鹽度馴化，光自養(yǎng)轉(zhuǎn)換和鹽度馴化后的微藻接種至養(yǎng)殖尾水中培養(yǎng)，接種密度為1×105?106，使微藻細(xì)胞在培養(yǎng)過程中協(xié)同凈化養(yǎng)殖排放廢水；本發(fā)明采用異養(yǎng)發(fā)酵的蛋白核小球藻，進(jìn)行光轉(zhuǎn)化和鹽度轉(zhuǎn)化后，使異養(yǎng)蛋白核小球藻具有處理無機(jī)碳、氮、磷等營(yíng)養(yǎng)鹽的能力，能夠應(yīng)用于海水養(yǎng)殖尾水凈化，避免了微藻光自養(yǎng)培養(yǎng)密度低、養(yǎng)殖情況不穩(wěn)定、采收難度大的缺點(diǎn)。