本發(fā)明涉及醫(yī)療廢棄物處理技術(shù)領(lǐng)域，具體為一種醫(yī)療廢棄物多級滅菌系統(tǒng)，包括進料殼體、進料口、出料口、進料電機、螺旋轉(zhuǎn)動軸以及分離機構(gòu)，所述進料殼體的外圓面上端靠近一側(cè)邊緣位置開設(shè)有進料口；所述進料殼體的一端中間位置固定連接有進料電機，且所述進料電機的輸出端貫穿進料殼體的外表面延伸至進料殼體內(nèi)部；所述進料電機的輸出端固定連接有螺旋轉(zhuǎn)動軸；所述進料殼體的外圓面下端靠近另一側(cè)邊緣位置開設(shè)有出料口；所述出料口的下端固定連接有分離機構(gòu)。本發(fā)明能夠有效的進行固液分離，并對固體廢棄物和液體廢棄物分別進行處理，能夠有效的防止醫(yī)療廢棄物對空氣造成污染和對工作人員造成感染。