本發(fā)明公開了一種雞糞生態(tài)化處理和回用系統(tǒng)及運(yùn)行方法，包括雞養(yǎng)殖系統(tǒng)（1）、水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)（2）、稻田濕地系統(tǒng)（3）三個模塊。雞養(yǎng)殖系統(tǒng)（1）日常運(yùn)行過程中產(chǎn)生的雞糞與溫室氣體，雞糞輸送至水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)（2）與稻田濕地系統(tǒng)（3）進(jìn)行處理與回用，氣體經(jīng)過甲烷提純收集，臭氣濃度降低至50再進(jìn)行外排、廢水通過稻田濕地系統(tǒng)凈化回用。本發(fā)明構(gòu)建養(yǎng)雞固廢、廢氣、廢水生態(tài)化處理裝置，通過與稻田濕地系統(tǒng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)聯(lián)用，實(shí)現(xiàn)污染物實(shí)時動態(tài)削減和抗性基因去除。本發(fā)明具有污染物削減效果好、魚塘無需投料、稻田無需施肥，操作簡單、投資省、運(yùn)行成本低等優(yōu)點(diǎn)。