本發(fā)明公開基于強(qiáng)化學(xué)習(xí)的蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)配體通道最優(yōu)路徑分析方法，包括如下步驟：獲取所述蛋白質(zhì)的靜態(tài)配體通道信息和全原子動(dòng)態(tài)信息，篩選組成通道的部分原子的動(dòng)態(tài)性并引入三維空間下的柵格法和原子碰撞檢測機(jī)制，構(gòu)造仿真環(huán)境；構(gòu)建強(qiáng)化學(xué)習(xí)模型，所述強(qiáng)化學(xué)習(xí)模型包括狀態(tài)、智能體、動(dòng)作和獎(jiǎng)勵(lì)；當(dāng)配體分子走出三維空間柵格地圖的邊界則給當(dāng)前狀態(tài)一個(gè)負(fù)的反饋值并返回上一狀態(tài)繼續(xù)訓(xùn)練，直至到達(dá)通道終點(diǎn)或者達(dá)到單輪最大探索步數(shù)，則本輪訓(xùn)練結(jié)束，輸出本輪訓(xùn)練結(jié)果；繼續(xù)下一輪訓(xùn)練，直至所有訓(xùn)練輪次全部結(jié)束，輸出蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)配體通道最優(yōu)路徑。本發(fā)明能夠協(xié)助配體分子找到到達(dá)催化活性中心位置的最優(yōu)路徑，具備一定的工程應(yīng)用參考價(jià)值。