本發(fā)明屬于植物基因工程領(lǐng)域。涉及水稻內(nèi)源雙向表達(dá)啟動(dòng)子的分離克隆及功能分析。本發(fā)明結(jié)合MSU和RAP數(shù)據(jù)庫中的RNA?seq數(shù)據(jù)以及CREP數(shù)據(jù)庫中的表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)在水稻基因組中選取了候選雙向啟動(dòng)子BIP1，通過實(shí)驗(yàn)證明它具有雙向表達(dá)活性。然后對(duì)其進(jìn)行5’和3’缺失分析，鑒定出其雙向表達(dá)調(diào)控區(qū)段以及控制其5’和3’方向基本表達(dá)活性的區(qū)段。隨后，利用生物信息學(xué)手段分析了BIP1在禾本科植物中的保守性。本發(fā)明公開了雙向啟動(dòng)子的篩選及分離克隆方法、轉(zhuǎn)化載體的構(gòu)建過程、水稻遺傳轉(zhuǎn)化過程和轉(zhuǎn)化植物的GUS組織化學(xué)染色、GUS蛋白活性檢測(cè)、GFP組織學(xué)分析、GFP定量分析和雙向啟動(dòng)子的保守性分析等方法。