本文描述了一種用于分析二分圖數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)以縮合代謝網(wǎng)絡(luò)的反應(yīng)路徑的方法。細(xì)胞的代謝網(wǎng)絡(luò)構(gòu)造為二分圖,在二分圖中,分子節(jié)點(diǎn)表示代謝中的分子,連接分子節(jié)點(diǎn)的邊表示化學(xué)反應(yīng)或過程。二分圖中的分子節(jié)點(diǎn)根據(jù)導(dǎo)入和導(dǎo)出每個(gè)節(jié)點(diǎn)的邊的數(shù)量進(jìn)行分類。如果二分圖的結(jié)構(gòu)指示分子節(jié)點(diǎn)對代謝網(wǎng)絡(luò)的數(shù)學(xué)模型的通量值解沒有貢獻(xiàn),則從二分圖中阻斷或去除該節(jié)點(diǎn)及其連接的反應(yīng)路徑。因此,可以降低二分圖的復(fù)雜度,并識別關(guān)鍵的節(jié)點(diǎn)和路徑。
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