本發(fā)明公開(kāi)了一種藥物分子特征屬性的預(yù)測(cè)方法及預(yù)測(cè)裝置。所述預(yù)測(cè)方法包括：構(gòu)建原始藥物分子屬性數(shù)據(jù)集；對(duì)原始藥物分子屬性數(shù)據(jù)集進(jìn)行預(yù)處理，獲得訓(xùn)練樣本，訓(xùn)練樣本包括分子指紋、分子圖結(jié)構(gòu)信息和分子特征屬性值；以分子指紋和分子圖結(jié)構(gòu)信息作為輸入，以分子特征屬性作為輸出，建立一個(gè)多輸入預(yù)測(cè)模型，利用訓(xùn)練樣本對(duì)預(yù)先構(gòu)建的多輸入預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練，得到最終預(yù)測(cè)模型；將新獲取的分子屬性數(shù)據(jù)輸入到最終預(yù)測(cè)模型，得到分子特征屬性預(yù)測(cè)值。該訓(xùn)練樣本充分考慮了藥物小分子的空間幾何特征和物理化學(xué)特征，該最終預(yù)測(cè)模型能有效地預(yù)測(cè)分子特征屬性值，且具有較高的準(zhǔn)確率。