本發(fā)明提出了一種基于DNA鏈置換狀態(tài)觀測(cè)器的同結(jié)構(gòu)的混沌系統(tǒng)同步方法，其步驟為：根據(jù)DNA鏈置換的化學(xué)反應(yīng)和數(shù)學(xué)微分表達(dá)式之間的轉(zhuǎn)化關(guān)系設(shè)計(jì)DNA化學(xué)反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)，將DNA化學(xué)反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)轉(zhuǎn)換為微分表達(dá)式并合并構(gòu)建驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)；構(gòu)建線性變換系統(tǒng)；構(gòu)造耦合控制器下的新線性變換系統(tǒng)，在耦合控制器的作用下驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)和新線性變換系統(tǒng)達(dá)到耦合同步；構(gòu)建狀態(tài)觀測(cè)器；設(shè)計(jì)與驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)相同的響應(yīng)系統(tǒng)；根據(jù)狀態(tài)觀測(cè)器與響應(yīng)系統(tǒng)設(shè)計(jì)柔性變結(jié)構(gòu)控制器，將柔性變結(jié)構(gòu)控制器加入到響應(yīng)系統(tǒng)中得到微分方程組，使?fàn)顟B(tài)觀測(cè)器與響應(yīng)系統(tǒng)達(dá)到同步。本發(fā)明的柔性變結(jié)構(gòu)控制器對(duì)實(shí)現(xiàn)同結(jié)構(gòu)的混沌系統(tǒng)之間的同步完全有效，狀態(tài)觀測(cè)器可以估計(jì)驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)的狀態(tài)且有一定的魯棒性。