本發(fā)明公開了一種基于深度學(xué)習(xí)的RBP結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)算法,首先從RNA序列信息出發(fā),增加二級(jí)結(jié)構(gòu)特征作為輸入;通過基于強(qiáng)化學(xué)習(xí)的生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò),對(duì)RBP進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng),目的是通過增強(qiáng)訓(xùn)練集規(guī)模來提高預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)能力;提出卷積自編碼器作為預(yù)測(cè)模型,預(yù)訓(xùn)練過程包括編碼器和解碼器的訓(xùn)練,提取已訓(xùn)練好的編碼器微調(diào);能夠預(yù)測(cè)未知結(jié)合位點(diǎn)的RNA序列;通過卷積自編碼器的卷積核,能夠提取與RNA發(fā)生結(jié)合的序列motif與結(jié)構(gòu)motif,探究不同RBP的序列和結(jié)構(gòu)特異性;對(duì)于每種RBP數(shù)據(jù)都訓(xùn)練一個(gè)對(duì)應(yīng)的預(yù)測(cè)模型;對(duì)于一個(gè)待預(yù)測(cè)的RNA序列,首先編碼序列,然后將編碼信息輸入到已訓(xùn)練好的各個(gè)預(yù)測(cè)模型中,最終的結(jié)果即為特異RNA與各個(gè)RBP對(duì)應(yīng)的結(jié)合概率。
聲明:
“基于深度學(xué)習(xí)的RBP結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)算法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請(qǐng)聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)