本發(fā)明涉及基于ARDGPR模型預(yù)測RNA中原子高階多極距的計(jì)算方法:通過量子力學(xué)計(jì)算軟件Gaussian09優(yōu)化所有RNA分子小片段的結(jié)構(gòu),并通過AIMALL軟件積分計(jì)算分子中原子的高階多極距;對每一種小分子片段,選擇部分小分子片段中各原子坐標(biāo)位置以及原子的高階多極距訓(xùn)練ARDGPR模型;并通過剩余的小分子片段構(gòu)象作為測試集驗(yàn)證ARDGPR模型的預(yù)測結(jié)果。本發(fā)明通過ARDGPR模型預(yù)測代替量子力學(xué)計(jì)算,在基于力場信息的分子力學(xué)模擬的基礎(chǔ)上,可以快速的針對不同構(gòu)象給出能量及原子的高階多極距等物理化學(xué)參數(shù)信息。同時(shí)通過訓(xùn)練好的ARDGPR模型預(yù)測原子的高階多極距,時(shí)間少、成本低且預(yù)測精度高,方法簡便,能夠節(jié)省大量的人力、物力和財(cái)力,為提高RNA分子力場模擬精確度提供相應(yīng)的基礎(chǔ)工具與快捷途徑。
聲明:
“ARDGPR模型預(yù)測RNA中原子多極距的計(jì)算方法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)