公開(kāi)了基于深度學(xué)習(xí)的數(shù)字染色方法和系統(tǒng)，其使得能夠基于使用熒光顯微鏡獲得的自發(fā)熒光圖像從未標(biāo)記或未染色樣本中創(chuàng)建數(shù)字/虛擬染色的顯微圖像。該系統(tǒng)和方法特別適用于創(chuàng)建由病理學(xué)家進(jìn)行分析的未標(biāo)記/未染色的組織樣本的數(shù)字/虛擬染色的完整幻燈片圖像(WSI)。該方法繞過(guò)了標(biāo)準(zhǔn)的組織化學(xué)染色過(guò)程，節(jié)省了時(shí)間和成本。該方法基于深度學(xué)習(xí)，并且在一個(gè)實(shí)施例中，利用使用生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)將未標(biāo)記樣本的熒光圖像轉(zhuǎn)換為與同一樣本的化學(xué)染色版本的明場(chǎng)圖像等效的圖像。這種未標(biāo)記的數(shù)字染色方法省去了繁瑣且昂貴的組織化學(xué)染色程序，并顯著簡(jiǎn)化了病理學(xué)和組織學(xué)領(lǐng)域的組織制備。