本發(fā)明公開了一種基于關(guān)鍵蛋白質(zhì)和局部適應(yīng)的蛋白質(zhì)復(fù)合物識(shí)別方法,基于關(guān)鍵蛋白質(zhì)對(duì)有機(jī)體生命活動(dòng)的重要性,本發(fā)明在考慮蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)涮匦缘幕A(chǔ)上,以關(guān)鍵蛋白質(zhì)作為種子,提出了一種基于關(guān)鍵蛋白質(zhì)和局部適應(yīng)的蛋白質(zhì)復(fù)合物識(shí)別方法(EPOF)。該方法既能用于非加權(quán)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),也能用于加權(quán)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。該方法只需根據(jù)蛋白質(zhì)相互作用信息和關(guān)鍵蛋白質(zhì)信息就能夠較準(zhǔn)確地識(shí)別蛋白質(zhì)復(fù)合物,并且可以一次預(yù)測(cè)出大量的蛋白質(zhì)復(fù)合物,解決了化學(xué)實(shí)驗(yàn)方法成本昂貴和耗時(shí)等問題。