本發(fā)明公開了一種基于對比學(xué)習(xí)的分子圖表示學(xué)習(xí)方法，包括：獲取每個分子的分子指紋表示，計算每兩個分子指紋之間的相似度；收集全量的化學(xué)官能團(tuán)信息，為分子中的每個原子匹配對應(yīng)的官能團(tuán)；用異構(gòu)圖對分子圖建模；利用結(jié)構(gòu)感知分子編碼器中的RGCN編碼分子中每個原子的表示及其所屬官能團(tuán)的表示，通過聚合函數(shù)將分子映射到特征空間，得到具有結(jié)構(gòu)感知的特征表示；根據(jù)分子之間的指紋相似度，選取正、負(fù)樣本，在特征空間中進(jìn)行對比學(xué)習(xí)；在大樣本分子數(shù)據(jù)集上利用對比學(xué)習(xí)的方法進(jìn)行訓(xùn)練，得到具有結(jié)構(gòu)感知的分子編碼器，應(yīng)用于下游分子屬性的預(yù)測任務(wù)。本發(fā)明有助于捕捉更豐富的分子結(jié)構(gòu)信息，解決分子屬性預(yù)測的問題。