本發(fā)明涉及新能源汽車(chē)整車(chē)控制技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種新能源汽車(chē)的VCU控制系統(tǒng)及控制方法，包括CANID模塊、硬件信號(hào)模塊、其他模塊及Flash模塊，所述CANID模塊的輸出端與所述Flash模塊的輸入端連接，所述硬件信號(hào)模塊的輸出端與所述Flash模塊的輸入端連接，所述其他模塊的輸出端與所述Flash模塊的輸入端連接，本發(fā)明所述的一種基于Bootloader加載方式的VCU控制系統(tǒng)及控制方法，在同一VCU硬件平臺(tái)上載有三種控制系統(tǒng)的軟件，VCU的F0中的Bootloader引導(dǎo)程序，通過(guò)CANID模塊、硬件信號(hào)模塊及其他模塊三種方式中的一種即可觸發(fā)并引導(dǎo)啟動(dòng)相應(yīng)的F1純電動(dòng)整車(chē)系統(tǒng)控制程序、F2混合動(dòng)力系統(tǒng)整車(chē)控制程序、F3燃料電池系統(tǒng)整車(chē)控制程序，實(shí)現(xiàn)多合一控制系統(tǒng)。